2015年8月《干细胞临床研究管理办法（试行）》发布，明确规定，干细胞治疗相关技术不再按照第三类医疗技术管理。随后，我国干细胞临床研究采用类双轨制管理。一是在国家卫生健康委员会和国家药品监督管理局申请机构和项目的双备案；二是在国家药品监督管理局申请药品注册临床试验。

2016年5月30日，国家卫计委官网公示了30家首批通过备案的干细胞临床研究机构。上海市东方医院（同济大学附属东方医院）是首批30家备案机构之一（上海首批4家之一）。截至2022年5月31日，我国138家医疗机构通过国家干细胞临床研究机构的备案，完成备案项目129项.

面对国家重大卫生需求，东方医院干细胞临床研究机构有序开展干细胞临床研究，合计承担22项干细胞临床研究，其中5项国家备案项目和1项科技部新冠应急项目。聚焦心衰、糖尿病及其并发症、膝骨性关节炎三大方向推动干细胞临床研究的开展，培育了肺纤维化、帕金森病、阿尔兹海默病、急性脑梗死后遗症、老年衰弱症等新方向干细胞临床研究。项目备案数量位居全国前列。目前临床研究结果显示移植后均未出现严重不良反应，未发生与干细胞相关不良事件，证明细胞安全可靠。